Chương trình tài trợ nghiên cứu cơ bản trong khoa học tự nhiên đã được NAFOSTED triển khai từ năm 2009, được cộng đồng các nhà khoa học đánh giá là một bước tiến đột phá trong quản lý hoạt động nghiên cứu khoa học ở Việt Nam.
Ông Đỗ Tiến Dũng, Quyền Giám đốc điều hành NAFOSTED cho biết, tính đến nay NAFOSTED đã tài trợ được tổng số 487 đề tài thuộc ngành khoa học tự nhiên. Năm 2011, NAFOSTED tiếp nhận mới 327 hồ sơ đề tài thuộc 7 nhóm ngành từ 95 viện nghiên cứu, trường đại học và tổ chức khoa học khác trên cả nước. Hiện nay, NAFOSTED đã hoàn thành việc tổ chức đánh giá xét chọn và đang tiến hành ký hợp đồng tài trợ đợt 1 với 151 đề tài được hội đồng quản lý phê duyệt. Các đề tài có cùng chủ nhiệm đề tài với các đề tài năm 2009 sẽ được xem xét phê duyệt sau khi kết thúc các đề tài năm 2009, dự kiến vào tháng 1 năm 2012.
Theo thông tin từ trang Web ISIKNOWLEDE, tính đến 30/12/2011, số lượng các kết quả công bố trên các tạp chí khoa học được ISI xếp hạng của các đề tài nghiên cứu cơ bản trong khoa học tự nhiên do NAFOSTED tài trợ là 464. Tỷ lệ các kết quả công bố của các đề tài do NAFOSTED tài trợ so với tổng số các bài báo có tác giả Việt Nam trên các tạp chí khoa học được ISI xếp hạng đã tăng lên một cách đáng kể qua các năm, từ 4% năm 2009 lên 12% năm 2010 và 20 % năm 2011.
Cũng trong năm 2011, NAFOSTED cũng tiếp tục thực hiện việc cấp kinh phí cho 29 đề tài nghiên cứu khoa học và đổi mới công nghệ đã được phê duyệt từ năm 2008, 2009 do doanh nghiệp thực hiện theo nghị định 119/1999/NĐ-CP của Chính phủ. Kết quả nghiên cứu một số đề tài đã được sử dụng trực tiếp tại doanh nghiệp; sản phẩm đã được thương mại hóa, mang lại lợi ích kinh tế doanh nghiệp nói riêng và xã hội nói chung.
Có thể nói, một trong những sự kiện nổi bật nhất trong hoạt động KH&CN của NAFOSTED trong năm qua là NAFOSTED đã cấp kinh phí hỗ trợ cho dự án KH&CN “Nghiên cứu thiết kế chi tiết và công nghệ chế tạo, lắp ráp, hạ thủy giàn khoan tự nâng 90m nước phù hợp với điều kiện Việt Nam” thuộc Chương trình phát triển sản phẩm cơ khí trọng điểm theo Quyết định số 10/2009/QĐ- TTg của Chính phủ. Công trình đã được cơ quan Đăng kiểm Hàng hải Hoa kỳ cấp giấy chứng nhận theo tiêu chuẩn quốc tế. Giàn khoan tự nâng 90m nước cũng vừa được bầu là 1 trong 10 sự kiện khoa học và công nghệ nổi bật năm 2011.
Phát biểu tại Lễ Tổng kết, Thứ trưởng Lê Đình Tiến cho rằng, với 3 năm đi vào hoạt động, đó không phải là thời gian dài nhưng NAFOSTED đã làm được nhiều việc rất đáng ghi nhận. Những kết quả đó bước đầu đã khằng định bước đi đúng hướng phù hợp với đặc thù nghiên cứu khoa học, từng bước góp phần đưa khoa học Việt Nam hướng tới được chuẩn mực khoa học khu vực và quốc tế. NAFOSTED đã dần tạo được niềm tin, ủng hộ của cộng đồng xã hội, đặc biệt là các nhà khoa học, thương hiệu NAFOSTED ngày càng được nhiều người tin tưởng.
Tuy nhiên, Thứ trưởng cũng cho rằng, năm tới NAFOSTED cần có những hoạt động mới, sáng tạo hơn nữa để giữ vững thương hiệu mà mình đã gây dựng được. Bên cạnh đó, cũng cần tăng cường hơn nữa việc mở rộng hợp tác quốc tế với các nước có nền khoa học phát triển trên thế giới để nâng cao chất lượng của các công trình nghiên cứu cũng như tạo điều kiện để các nhà khoa học Việt Nam giao lưu với các nhà khoa học trên thế giới từng bước đưa khoa học Việt Nam hòa nhập với khu vực và thế giới.