Nghị định quy định về hình thức, nội dung, thẩm quyền, trình tự, thủ tục hợp tác, đầu tư với nước ngoài trong lĩnh vực KH&CN; không áp dụng trong việc hợp tác, đầu tư với nước ngoài để thành lập trường đại học, học viện, trường cao đẳng.
6 lĩnh vực Nhà nước khuyến khích tổ chức, cá nhân nước ngoài hợp tác, đầu tư bao gồm: 1- Nghiên cứu cơ bản trong lĩnh vực khoa học tự nhiên; 2 - Nghiên cứu ứng dụng và phát triển công nghệ thông tin, công nghệ sinh học, công nghệ vật liệu mới, công nghệ tự động hoá và cơ điện tử, năng lượng nguyên tử và các dạng năng lượng mới, công nghệ vũ trụ, công nghệ cơ khí - chế tạo máy, các công nghệ bảo quản và chế biến nông sản, thực phẩm, công nghệ xử lý chất thải; 3 - Đào tạo và phát triển nhân lực công nghệ cao; 4 - Phát triển doanh nghiệp công nghệ cao tại Việt Nam; 5 - Chuyển giao công nghệ và dịch vụ KH&CN; 6 - Lập hoặc đóng góp xây dựng các quỹ phát triển KH&CN tại Việt Nam.
Theo Nghị định này, việc hợp tác với nước ngoài trong lĩnh vực KH&CN được thông qua nhiều hình thức như: viện trợ, tài trợ, biếu, hiến, tặng (gọi chung là tài trợ) để hoạt động KH&CN; hợp đồng KH&CN; liên kết, tham gia hoạt động KH&CN với nước ngoài. Việc hợp tác với nước ngoài trong lĩnh vực KH&CN phải được lập thành hợp đồng hoặc văn bản thoả thuận hợp tác. Nguyên tắc, nội dung, hình thức của văn bản hợp tác trong lĩnh vực KH&CN do Bộ KH&CN quy định.
Về đầu tư nước ngoài trong lĩnh vực KH&CN tại Việt Nam, thực hiện thông qua 2 hình thức đầu tư trực tiếp và đầu tư gián tiếp. Trong đó, với vốn đầu tư trực tiếp, cần thành lập tổ chức KH&CN, doanh nghiệp KH&CN 100% vốn đầu tư nước ngoài hoặc liên doanh.
Các tổ chức, cá nhân Việt Nam muốn đầu tư ra nước ngoài trong lĩnh vực KH&CN, ngoài các quy định của pháp luật về đầu tư trực tiếp ra nước ngoài phải đáp ứng 3 điều kiện: có dự án đầu tư ra nước ngoài trong lĩnh vực KH&CN, được phép của Bộ KH&CN; được Bộ Kế hoạch và Đầu tư cấp Giấy chứng nhận đầu tư.
Để thành lập văn phòng đại diện, chi nhánh tại Việt Nam, tổ chức KH&CN nước ngoài phải đáp ứng một số điều kiện như: là tổ chức được pháp luật quốc gia nơi tổ chức đó thành lập hoặc đăng ký hoạt động công nhận hợp pháp; đã hoạt động từ 1 năm trở lên (nếu lập văn phòng đại diện) hoặc 5 năm trở lên (nếu lập chi nhánh) tính từ khi được thành lập hoặc đăng ký hoạt động hợp pháp tại quốc gia nơi tổ chức đó thành lập;…
Khi cần cấp, cấp lại, sửa đổi, bổ sung, gia hạn Giấy phép thành lập văn phòng đại diện, chi nhánh, tổ chức KH&CN nước ngoài phải làm thủ tục tại Bộ KH&CN.