Hội nghị đã nghe báo cáo tổng hợp đánh giá tình hình thực hiện các nhiệm vụ của Viện. Báo cáo không chỉ đánh giá hoạt động năm 2011 mà còn đánh giá hoạt động của Viện trong 5 năm gần đây (2007-2011), đặc biệt nhấn mạnh phân tích các mặt tồn tại, các điểm bất hợp lý trong từng mặt công tác cụ thể. Trong phần phương hướng, báo cáo không chỉ vạch kế hoạch cho năm 2012 mà còn đưa ra các giải pháp cụ thể khắc phục các mặt tồn tại theo từng giai đoạn, sẵn sàng chuyển đổi tổ chức sang hoạt động tự chủ vào năm 2014.
Ngoài ra Hội nghị còn nghe một số báo cáo khác như báo cáo kết quả công tác năm 2011 và phương hướng hoạt động của Ban Thanh tra nhân dân; báo cáo kết quả thực hiện công tác thi đua năm 2011. Các đại biểu tham dự và khách mời cũng đã có nhiều tham luận đóng góp cho Hội nghị. Hội nghị đã thông qua nghị quyết Hội nghị với từng chỉ tiêu cụ thể như: thi đua khen thưởng, thu nhập bình quân người lao động, nâng cao chất lượng công tác, nâng cao chất lượng nguồn nhân lực, tăng tỷ lệ các kết quả sau nghiên cứu đưa vào ứng dụng trong đời sống.
Về hoạt động nghiên cứu triển khai, Viện sẽ triển khai thực hiện các hướng nghiên cứu có thế mạnh theo chiến lược phát triển của Viện, gắn với nhu cầu thị trường, đồng thời mở rộng sang các lĩnh vực ưu tiên mới của đời sống kinh tế xã hội như năng lượng tái tạo, bảo vệ môi trường, an toàn vệ sinh thực phẩm,…; thực hiện tốt, có chất lượng, đúng tiến độ các nhiệm vụ KH&CN năm 2012 gồm 4 nhiệm vụ cấp Nhà nước, 18 đề tài, dự án cấp Bộ, 15 đề tài cấp cơ sở. Toàn Viện biểu quyết thống nhất trong năm 2012 tối thiểu 30% các kết quả nghiên cứu đưa ngay vào ứng dụng thực tiễn.
Về công tác tổ chức, xây dựng đội ngũ, Viện sẽ tiếp tục kiện toàn tổ chức bộ máy nhân sự theo hướng thực hiện cơ chế tự chủ, tự chịu trách nhiệm; tiếp tục xây dựng, hoàn thiện bộ các quy chế của Viện theo quy định của Nghị định 115 và các văn bản hướng dẫn thực hiện. Viện sẽ chú trọng nâng cao chất lượng nguồn nhân lực, quan tâm công tác đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, đặc biệt đối với cán bộ trong quy hoạch và cán bộ trẻ.
Toàn thể cán bộ, công chức, viên chức của Viện nêu cao quyết tâm đạt danh hiệu “Tập thể lao động xuất sắc”; Công đoàn Viện đạt danh hiệu “Tổ chức công đoàn vững mạnh xuất sắc”; Ít nhất 90% cán bộ, viên chức đạt danh hiệu “Lao động tiên tiến”, trong đó 15% đạt danh hiệu “Chiến sỹ thi đua cấp cơ sở”.
Phát biểu tại Hội nghị, Chủ tịch Công đoàn Bộ KH&CN Đặng Quang Huấn chia sẻ mong muốn Ban Chấp hành Công đoàn cùng toàn thể cán bộ, công chức, viên chức của Viện Ứng dụng Công nghệ đoàn kết, đồng thuận, Ban Chấp hành Công đoàn là đầu mối vận động cán bộ, công chức, viên chức hoàn thành tốt nhiệm vụ chính trị của Viện. Cùng với đó là việc thực hiện tốt quy chế dân chủ cơ sở, tổ chức Hội nghị cán bộ, công chức, viên chức năm 2012. Ban Lãnh đạo của Viện cũng như Công đoàn, Đoàn Thanh niên và các đoàn thể thực hiện tốt kiến nghị của Ban Thanh tra nhân dân, đặc biệt là đối với quy chế dân chủ, quy chế chi tiêu nội bộ. Đồng chí Đặng Quang Huấn đề nghị Ban Lãnh đạo Công đoàn dưới sự lãnh đạo của cấp Ủy Đảng phối hợp với các tổ chức thực hiện tốt phong trào do Công đoàn Bộ cũng như Công đoàn viên chức phát động.