Công đoàn Cục Công tác phía Nam (CTPN) luôn bám sát phương hướng, nhiệm vụ, Nghị quyết công đoàn đã đặt ra và phương hướng cụ thể của từng năm trong nhiệm kỳ 2020 - 2023. Công đoàn Cục đã hoạt động trong điều kiện khó khăn do tác động nặng nề của dịch Covid-19 trong 2 năm 2020 - 2021 tại Tp. Hồ Chí Minh; tập thể Đoàn viên Công đoàn (ĐVCĐ) đã rất nỗ lực, cố gắng để vừa hoàn thành nhiệm vụ chuyên môn, vừa giữ vững, duy trì các hoạt động công đoàn cũng như tích cực tham gia các hoạt động phong trào do công đoàn cấp trên phát động và làm tốt công tác chính sách (đảm bảo lương, bảo hiểm xã hội, thăm hỏi, hiếu, hỷ,...). Công tác hậu cần, phục vụ đảm bảo cho các đoàn công tác của lãnh đạo Bộ, Văn phòng, các Vụ, Cục chức năng thuộc Bộ tại các tỉnh thành phía Nam. Nhiệm vụ hợp tác quốc tế và phát triển tiềm lực KH&CN được chú trọng; hoạt động hỗ trợ khởi nghiệp, đổi mới sáng tạo có nhiều kết quả bước đầu khả quan. Qua đó nhiều tập thể, cá nhân được Công đoàn Viên chức Việt Nam, Công đoàn Bộ Khoa học và Công nghệ, khen thưởng các danh hiệu "Công đoàn cơ sở vững mạnh, xuất sắc", “công đoàn viên xuất sắc”, nữ đoàn viên Công đoàn "Giỏi việc nước, đảm việc nhà",…
Với tinh thần "Đổi mới - Dân chủ - Đoàn kết - Phát triển", Đại hội đã bầu Ban Chấp hành Công đoàn nhiệm kỳ tới gồm các đồng chí: Huỳnh Văn Tùng, Lưu Tiến Dũng và Trần Hà Hoàng Việt.
Tới dự và phát biểu tại Đại hội Công đoàn Cục CTPN, đồng chí Đỗ Xuân Ngọc - Phó chủ tịch phụ trách Công đoàn Bộ Khoa học và Công nghệ đánh giá cao những kết quả mà Công đoàn Cục CTPN đã đạt được trong 03 năm qua như: chăm lo cho đời sống vật chất, tinh thần, khám sức khỏe định kỳ cho ĐVCĐ; tổ chức tham quan, nghỉ mát; tổ chức chúc mừng sinh nhật theo tháng, tổ chức gặp mặt, tọa đàm nhân các ngày lễ 8/3, 20/10; tham gia hội thao: bóng đá, bóng bàn, cầu lông với các công đoàn bạn.... Trong nhiệm kỳ tới, đồng chí Ngọc đề nghị Công đoàn Cục thực hiện tốt một số nhiệm vụ sau: Phát huy vai trò của tổ chức Công đoàn, là đại diện chăm lo, bảo vệ quyền, lợi ích hợp pháp, chính đáng của công đoàn viên; Vận động, tuyên truyền ĐVCĐ thực hiện tốt nhiệm vụ chuyên môn; quan tâm nắm bắt tâm tư nguyện vọng ĐVCĐ; xây dựng Công đoàn cơ sở vững mạnh; đổi mới nội dung, các hình thức sinh hoạt; thực hiện tốt công tác tuyên truyền, phổ biến chủ trương của Đảng, chính sách, pháp luật của Nhà nước, chấp hành nghiêm các Nghị quyết, Chỉ thị của Đảng, và kỷ luật lao động, nội quy, quy định của Cục, hoàn thành chỉ tiêu Ban Chấp hành Công đoàn cơ sở đề xuất.