Quy chế nêu rõ nội dung, trách nhiệm và phương pháp phối hợp lãnh đạo về công tác: quán triệt, triển khai các Nghị quyết của Đảng, của Quốc hội, của Chính phủ và các văn bản pháp luật của Nhà nước; lãnh đạo thực hiện nhiệm vụ chính trị, chuyên môn; công tác thành lập, sáp nhập hoặc giải thể các đơn vị trực thuộc Bộ; bổ nhiệm, miễn nhiệm, điều động, luân chuyển, đào tạo, bồi dưỡng và quy hoạch cán bộ; lãnh đạo các tổ chức đoàn thể; xây dựng tổ chức đảng, xây dựng cơ quan, đơn vị trong sạch, vững mạnh;… đảm bảo phát huy dân chủ cơ sở thực hiện tốt nhiệm vụ chính trị, chuyên môn của ngành theo tinh thần Nghị quyết Hội nghị lần thứ 6 Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XI (Nghị quyết số 20-NQ/TW) về phát triển KH&CN phục vụ sự nghiệp công nghiệp hóa, hiện đại hóa trong điều kiện kinh tế thị trường định hướng xã hội chủ nghĩa và hội nhập quốc tế.